• สำนักงานอธิการบดี
  
  • กองกลาง
    
    • มูลนิธิมหาจุฬาลงกรณ์ราชวิทยาลัย
      
    • มหาจุฬาบรรณาคาร
      
    • โรงพิมพ์มหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย
      
  • กองกิจการนิสิต
    
  • กองกิจการพิเศษ
    
  • กองกิจการวิทยาเขต
    
  • กองคลังและทรัพย์สิน
    
  • กองนิติการ
    
  • กองแผนงาน
    
  • กองวิชาการ
    
    • สำนักพิมพ์มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย
      
  • กองวิเทศสัมพันธ์
    
  • กองสื่อสารองค์กร
    
  • กองอาคารสถานที่และยานพาหนะ
    
  • สำนักงานประกันคุณภาพ
    
  • สำนักงานตรวจสอบภายใน
    
  • สำนักงานพระสอนศีลธรรม
    
  • สำนักงานสภามหาวิทยาลัย
    
• สถาบันภาษา
  
  • ส่วนงานบริหาร
    
  • ส่วนวิชาการ
    
  • โครงการหลักสูตร สาขาสันติศึกษา
    
• สถาบันวิจัยพุทธศาสตร์
  
  • ส่วนงานบริหาร
    
  • ส่วนวางแผนและพัฒนาการอบรม
    
• สถาบันวิปัสสนาธุระ
  
  • ส่วนงานบริหาร
    
  • ส่วนวางแผนและพัฒนาการอบรม
    
• สำนักทะเบียนและวัดผล
  
  • ส่วนทะเบียนนิสิต
    
  • ส่วนประเมินผลการศึกษา
    
• สำนักส่งเสริมพระพุทธศาสนาและบริการสังคม
  
  • ส่วนงานบริหาร
    
  • ส่วนธรรมนิเทศ
    
  • อภิธรรมโชติกะวิทยาลัย
    
  • โรงเรียนพุทธศาสนาวันอาทิตย์
    
• สำนักหอสมุดและเทคโนโลยีสารสนเทศ
  
  • ส่วนหอสมุดกลาง
    
  • ส่วนเทคโนโลยีสารสนเทศ
    
• ศูนย์อาเซียนศึกษา
  
  • ส่วนงานบริหาร
    
  • ส่วนวิจัย สารสนเทศและบริการวิชาการ
    
• วิทยาลัยพุทธศาสตร์นานาชาติ
  
  • ส่วนงานบริหาร
    
  • ส่วนวิจัย สารสนเทศและบริการวิชาการ
    
• วิทยาลัยพระธรรมทูต
  
  • สำนักงานวิทยาลัย
    
  • สำนักงานวิชาการ
• สถาบันพระไตรปิฏกศึกษา
  

วิทยาเขต ๑๐ แห่ง

• ๑.วิทยาเขตหนองคาย
  
• ๒.วิทยาเขตนครศรีธรรมราช
  
• ๓.วิทยาเขตเชียงใหม่
  
• ๔.วิทยาเขตขอนแก่น
  
• ๕.วิทยาเขตนครราชสีมา
  
• ๖.วิทยาเขตอุบลราชธานี
  
• ๗.วิทยาเขตแพร่
  
• ๘.วิทยาเขตสุรินทร์
  
• ๙.วิทยาเขตพะเยา
  
• ๑๐.วิทยาเขตบาฬีศึกษาพุทธโฆส
  
• ๑๑.วิทยาเขตนครสวรรค์

วิทยาลัยสงฆ์ ๑๘ แห่ง

• ๑.วิทยาลัยสงฆ์เลย
  
• ๒.วิทยาลัยสงฆ์นครพนม
  
• ๓.วิทยาลัยสงฆ์ลำพูน
  
• ๔.วิทยาลัยสงฆ์พุทธชินราช
  
• ๕.วิทยาลัยสงฆ์บุรีรัมย์
  
• ๖.วิทยาลัยสงฆ์ปัตตานี
  
• ๗.วิทยาลัยสงฆ์นครน่านเฉลิมพระเกียรติฯ
  
• ๘.วิทยาลัยสงฆ์พุทธโสธร
  
• ๙.วิทยาลัยสงฆ์นครลำปาง
  
• ๑๐.วิทยาลัยสงฆ์เชียงราย
  
• ๑๑.วิทยาลัยสงฆ์ศรีสะเกษ
  
• ๑๒.วิทยาลัยสงฆ์ราชบุรี
  
• ๑๓.วิทยาลัยสงฆ์พุทธปัญญาศรีทวารวดี
  
• ๑๔.วิทยาลัยสงฆ์พ่อขุนผาเมือง
  
• ๑๕.วิทยาลัยสงฆ์ร้อยเอ็ด
  
• ๑๖.วิทยาลัยสงฆ์ชัยภูมิ
  
• ๑๗.วิทยาลัยสงฆ์พิจิตร
  
• ๑๘.วิทยาลัยสงฆ์สุพรรณบุรี

ห้องเรียน ๓ แห่ง

• ๑.โครงการขยายห้องเรียนคณะพุทธศาสตร์ วัดพิกุลทอง จังหวัด สิงห์บุรี
  
• ๒.โครงการขยายห้องเรียนวิทยาเขตนครศรีธรรมราช จังหวัดสุราษฎร์ธานี
  
• ๓.โครงการขยายห้องเรียนคณะพุทธศาสตร์ วัดไชยชุมพลชนะสงคราม จังหวัดกาญจนบุรี
  

หน่วยวิทยบริการ ๑๓ แห่ง

• ๑.หน่วยวิทยบริการ คณะพุทธศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดหงษ์ประดิษฐาราม อำเภอหาดใหญ่ จังหวัดสงขลา
  
• ๒. หน่วยวิทยบริการ วิทยาลัยสงฆ์ขอนแก่น มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดอภิสิทธิ์ อำเภอเมือง จังหวัดมหาสารคาม
  
• ๓.หน่วยวิทยบริการ คณะสังคมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดใหญ่อินทาราม (พระอารามหลวง) อำเภอเมือง จังหวัดชลบุรี
  
• ๔. หน่วยวิทยบริการคณะสังคมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดป่าประดู่ (พระอารามหลวง) อำเภอเมือง จังหวัดระยอง
  
• ๕ .หน่วยวิทยบริการ คณะสังคมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย พุทธมณฑลจันทบุรี อำเภอเมือง จังหวัดจันทบุรี
  
• ๖. หน่วยวิทยบริการ คณะสังคมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดพระรูป อำเภอเมือง จังหวัดเพชรบุรี
  
• ๗.หน่วยวิทยบริการวิทยาลัยสงฆ์นครสวรรค์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดหนองขุนชาติ อำเภอหนองฉาง จังหวัดอุทัยธานี
  
• ๘.หน่วยวิทยบริการวิทยาลัยสงฆ์นครสวรรค์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดพระบรมธาตุ อำเภอเมือง จังหวัดกำแพงเพชร
  
• ๙. หน่วยวิทยบริการวิทยาลัยสงฆ์พุทธชินราช มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดท่านา อำเภอเมือง จังหวัดตาก
  
• ๑๐.หน่วยวิทยบริการ วิทยาลัยสงฆ์พุทธชินราช มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดหมอนไม้ อำเภอเมือง จังหวัดอุตรดิตถ์
  
• ๑๑.หน่วยวิทยบริการคณะสังคมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดป่าเลไลยก์วรวิหาร อำเภอเมือง จังหวัดสุพรรณบุรี
  
• ๑๒.หน่วยวิทยบริการคณะสังคมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย วัดสระแก้ว อำเภอเมือง จังหวัดสระแก้ว
  

สถาบันสมทบ ๖ แห่ง